熊文灿官至明崇祯朝兵部尚书兼右副都御史。《明史》认为：“流贼之肆毒也，祸始于杨鹤，成于陈奇瑜而炽于熊文灿、丁启睿。……疆场则剿抚乖方，庙堂则赏罚不当。偾师玩寇，贼势日张。”最后导致了明王朝的灭亡。这种说法，持论不公。
独木难撑大厦。熊文灿受命于财尽民穷、天下汹汹的危难之际，派饷增兵落实艰难，60余万军饷未能到位;将悍兵骄，宿将跋扈，不听指挥;山海关外对后金(清)作战的战事又不顺利。诸多因素叠加，熊文灿竭力补救，也无可奈何。把饥民之炽归罪于他，功过模糊，未免冤枉。
功过争议
尽平海盗，招降张献忠引杀身祸
熊文灿，字大濛，贵州永宁卫军籍，四川泸州人。明神宗万历三十四年(1606年)，由永宁卫学举贵州乡试第二名举人。万历三十五年，成第三甲第七十四名(总第148名进士)，授湖广黄州(今湖北省黄岗市黄州区)推官，行取为礼部精膳司主事;万历四十七年，升本部仪制司员外郎;明光宗泰昌元年(1620年)，再升祠祭司郎中。《明史》说他“出封琉球还，擢山东左参政、山西按察使、山东右布政使。忧归。自是徙家蕲水(今湖北省黄冈市浠水县)。崇祯元年(1628年)，起福建左布政使;三月，就拜右佥都御史，巡抚其地。五年二月，擢兵部右侍郎、右佥都御史，总督两广军务，兼巡抚广东。”
当时，明王朝面临的形势很不好：山海关外，满洲族虎视鲸吞;关内李自成、张献忠起义，遍地是揭竿而起的饥民;海上，更有众多海盗、红毛(葡萄牙人)和倭寇。熊文灿就是在这样的形势下去福建上任。在福建和两广，他成功招降海盗郑芝龙，委其为游击将军，即率旧部歼灭刘六、刘七、李魁奇、锺斌诸海贼。又指挥福建、广东两省官兵进剿勾结红毛为害百姓、甚至扣留朝廷命官的刘香。刘香战败，自焚溺死，余党千余人向浙江官府投降。历经长达8年的艰苦努力，海盗尽平，红毛、倭寇一时销声匿迹。
《明史》对熊文灿评价不公，即使如是功绩，也没有称道，而对他自请“办贼”，就更有异词，说是“文灿官闽、广久，积赀无算，厚以珍宝结中外权要，谋久镇岭南。会帝疑刘香未死，且不识文灿为人，遣中使假广西采办名，往觇之，既至，文灿盛有所赠遗，留饮十日。中使喜，语及中原寇乱。文灿方中酒，击案骂曰：‘诸臣误国耳。若文灿往，讵令鼠辈至是哉。’中使起立曰：‘吾非往广西采办也，衔上命觇公。公信有当世才，非公不足办此贼。’文灿出不意，悔失言，随言有五难四不可。中使曰：‘吾见上自请之，若上无所吝，即公不得辞矣。’文灿辞穷，应曰：‘诺’。”说得他一无是处。
明崇祯十年(1637年)，饥民起事日炽，阁臣杨嗣昌建“四正六隅”之策，不顾人民死活，增兵12万，增派兵饷白银280万两，“以陕西、河南、湖广、江北为四正，四巡抚分剿而专防;以延绥、山西、山东、江南、江西、四川为六隅，六巡抚分防而协剿。是谓十面之网。而总督、总理二臣，随贼所向专征讨”，剿办饥民。是年闰四月壬寅，以杨嗣昌荐，熊文灿被任命为“兵部尚书兼右副都御史，总理南京(南直隶)、河南、山(西)、陕(西)、(四)川、湖(广诸省)军务，驻郧阳(湖北襄阳)讨贼”。
“明季士大夫问钱谷不知，问甲兵不知。”熊文灿却是个能臣。他注意到，所谓“流贼”其实只是些铤而走险的饥民。老百姓吃不饱肚子，任你如何剿办，只会越剿越多。审时度势，他决定以招抚为主，剿办继之，成功招降了张献忠、罗汝才、李万庆、刘国能等一干“流寇”。不管这些人是真投降还是假投降，此举总算为被流动作战的农民军牵着鼻子团团转而疲于奔命的官军，为风雨飘摇的中央王朝，争得了喘息的时间和休整的机会。可是，由于当时的经济、政治等多方面原因，再加上崇祯皇帝本人刚愎自用与决策失误等，明王朝没能抓住这一线生机。崇祯十二年(1639年)五月乙丑，张献忠在谷城东山再起，群雄蜂起响应;秋七月壬申，“左良玉讨张献忠，败绩于罗猴山，总兵官罗岱被执死之”。“败书闻，帝大惊，诏逮文灿。特旨命(杨)嗣昌督师……九月二十九日抵襄阳，入文灿军，文灿就逮”，崇祯十三年(1640年)“冬十月癸丑，熊文灿弃市”。
功过因何模糊?《明史》对熊文灿研究不够，且莫说政绩、功过，就连他调动升迁情况，都未弄清楚。《明史》说，崇祯四年(1631年)，明王朝派使团出使琉球，为新登基的新琉球国王加封。又说熊文灿以礼部郎中参与“出封琉球还，擢山东左参政”。事实上，其时熊文灿早已从礼部调出，由山东而山西，又山东。而且，早在崇祯元年就已在福建作封疆大吏。
籍贯歧说
泸县云锦镇人，入籍永宁以谋科举
熊文灿籍贯，也有歧说。1998年，泸州市人民政府公布泸县云锦山下清道光 五 年(1825年)摩崖题刻“熊文灿故里”为“泸州市文物保护单位”。叙永县部分业余文史爱好者认为，万历甲寅，熊文灿“衔命如闽”过永宁，撰《蓬莱桥记》言“便道旋里”;今日叙永城外熊公坡，传说旧为熊文灿公馆;清嘉庆《直隶叙永厅志·选举》、清光绪《叙永永宁厅县合志·选举》均载熊文灿为永宁人。于是他们致信泸州市文物局，要求撤销泸州市人民政府1998年公布泸县云锦山下道光五年摩崖题刻“熊文灿故里”为“泸州市文物保护单位”的文件，并宣布熊文灿是永宁(今叙永县)人。
此外，《明史》卷二百六十《熊文灿传》：“熊文灿，贵州永宁卫人。”清顺治朝国子监祭酒吴伟业《绥寇纪略》：“熊文灿，黔之泸州人。”清乾隆《广东通志》卷27《职官》：“总督熊文灿，贵州泸江州人。”乾隆《福建通志》卷21《职官·总部》：“巡抚都御史……熊文灿，泸州人。”
众说纷纭，莫衷一是。年来考求史乘、田野勘查，证诸金石，最后查明熊文灿确是贵州永宁卫军籍的四川泸州(今泸县云锦镇)人。“卫”是明代创置的地方军事行政机关，“度要害地，系一郡者设所，连郡者设卫。大率五千六百人为卫……其军皆世籍”。只有官至兵部尚书，才能免除军籍为民。卫所之兵，无事屯田耕种，有事奉调出征。境内民户接受卫所管辖，不归州县。永宁卫隶属贵州，治所设在今泸州市叙永县西城，与设在叙永东城、隶属四川的永宁宣抚司(土司)同城而治，设有卫学。
明代贵州科举录取标准比四川低，冒籍其地应试，遂成终南捷径。“明嘉靖十六年(1537年)，贵州开科(取士)……未尝限其名额。由是四方游食、逋罪生、儒，皆冒永宁籍求试。……至是，御史孙襄请行禁止，部覆报允。”然而冒籍应试并未杜绝，泸州人熊文灿仍因有宗支世居其地而成功入籍永宁卫，入卫学。这一事实，反映在《熊氏族谱》里，就是“寄籍永宁”。
《熊氏族谱》记载，熊文灿墓在泸州新溪子(今泸县雅镇新溪村)“薄刀岭，墓门正对瓦窰滩”。这处墓葬，已于2002年由熊氏23世孙熊文材根据当地世代传言并在当地90岁老人杨云相指引下重新找到，地址、地形地貌与《熊氏族谱》所记相合。
2009年，泸州市政协文史委主任陈仕林实地勘查，走访当地老人，咸言“熊文灿是新溪子杨家女婿，《杨氏族谱》对此有载。与杨氏夫人合葬于此”。
其他文献也证明熊文灿是永宁卫籍泸州人。朱保炯、谢沛霖编《明清进士题名碑录索引》：“熊文灿，贵州永宁卫，明万历 35/3/74(四川泸州)。”按照该书凡例，意即“熊文灿，贵州永宁卫军籍，四川泸州人，明万历三十五年第三甲第七十四名进士。”
《万历(二十六年戊戌科)[三十五年丁未科]进士履历便览》：“贵州四人……永宁卫一人，熊文灿，心闻，《诗》二房，庚寅三月十五生，泸州人。丙午乡试二名，会试一百八名，三甲七十四名。”
反观《明史》，其说只是孤证。《明史》的底本是万斯同的《明史稿》。万先生布衣寒素，履历闻见制约，搜采难免未遍，考证或有欠周。前人对于《明史》多有订正，仅今中华书局标点本，对于《熊文灿传》就有4条校勘。
熊文灿户籍既在永宁“衔命如闽”路过，当然可以在其所撰《蓬莱桥记》里说是“便道旋里”。
熊文灿子孙世居泸县云锦而世系不乱，且旧居遗址犹在，我们有理由确认：熊文灿是今泸县云锦镇人，入籍永宁以谋科举，因而是贵州永宁卫军籍的泸州人。(赵永康)
